زادت حدة هجوم إبراهيم عيسى على الإسلاميين وتخطت حدود ذلك لتشمل الهجوم على الإسلام نفسه وعلى بعض علومه حيث اكد إبراهيم عيسى فى حلقته اليوم من برنامج إبراهيم والناس والتى تذاع على قناة القاهرة والناس أن الشعب المصرى مضحوك عليه ببعض الأمور التى ينسبها أصحابها للإسلام مؤكدا انه لايوجد شىء يسمى الطب النبوى لأن الرسول على حد قوله لم يكن طبيبا مؤكدا ان هؤلاء الذين يتحدثون عن الطب النبوى يسافرون للخارج للعلاج كما اعترض كذلك على مصطلح الإعجاز العلمي في القرآن قائلا "لمن يقولون إن الدين تحدث عن أن الطيران وجد في القرآن الكريم عليهم أن يجيبوا لماذا لم يصنع المسلمون الطائرة"
وواصل عيسى هجومه على الدكتور محمد مرسى والدكتور هشام قنديل مؤكدا ان وزراء مبارك كانوا أفضل بكثير من وزراء قنديل وأن بطرس غالى كان أفضل بمراحل من وزير مالية قنديل