ويتم إجراء جراحة شفط الدهون تحت مخدر كلى أو نصفى أو موضعى، وذلك حسب مكان الشفط وكمية الدهون المراد إزالتها،ويتم الشفط عن طريق حقن كميات محسوبة من المحاليل التى تعمل على إذابة الدهون وتقليل النزيف فى المنطقة المراد علاجها،وتؤدى عملية الحقن إلى إذابة الدهون وتفككها، مما يسهل من عملية الشفط فيما بعد، ويتم ذلك باستخدام أنابيب معينه يتراوح قطرها من 2-6 مم، ويتم إدخالها من خلال فتحات صغيرة جدا لا يتعدى طولها 0.5 سم، وهذه الأنابيب يتم توصيلها بجهاز شفط ذى قوة عالية، وتستغرق عملية الشفط من ساعة واحدة إلى ساعتين على حسب المنطقة المراد شفط الدهون منها.